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dnaman是一款LynnonBiosoft公司開發(fā)的生物序列解析軟件，包括了全部常規(guī)核酸及蛋白質(zhì)序列解析需求，包含多重序列排列、蛋白質(zhì)特性解析、質(zhì)粒圖譜繪制等模塊。其運(yùn)算速率、多功能特性、結(jié)果精確度與優(yōu)質(zhì)輸出表現(xiàn)，使之成為每位分子生物學(xué)從業(yè)者信賴的基礎(chǔ)器械。有需要的朋友趕快下載使用吧!

dnaman使用教程

如何用DNAMAN軟件得到反向互補(bǔ)的DNA序列

1、打開在本站下載好的DNAMAN軟件，打開軟件后，點(diǎn)擊軟件頂部的點(diǎn)擊File，在彈出的選擇中選擇new

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2、在新建好的對話框中輸入DNA序列

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3、輸入完后，同時(shí)按住鍵盤上Ctrl和A，選中序列，并單擊軟件頂部“seq”圖中以為大家標(biāo)注出來。

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4、然后點(diǎn)擊軟件頂部的Sequence選項(xiàng)，在彈出的選項(xiàng)中點(diǎn)擊Display，在二級菜單中點(diǎn)擊Rev.Compl.Sequence

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5、然后就可以得到原序列的反向互補(bǔ)序列。

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dnaman功能介紹

1、數(shù)據(jù)庫管理

選擇 “數(shù)據(jù)庫”|“管理命令”，即可打開 “數(shù)據(jù)庫管理器” 對話框。

2、DNA 與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫

軟件的數(shù)據(jù)庫功能，支持用戶按不同類別整理 DNA 與蛋白質(zhì)序列。

3、記錄信息編輯

可編輯特定記錄的相關(guān)信息，序列列表框中所有記錄按字母順序或錄入順序排列。每條記錄名稱旁的數(shù)字為記錄 ID，由 DNAMAN 自動(dòng)分配，因此不同記錄可使用相同名稱。

4、序列相似性掃描

可在默認(rèn)數(shù)據(jù)庫中檢索所有序列記錄，查找當(dāng)前序列的同源序列。默認(rèn)數(shù)據(jù)庫為 DNA 序列時(shí)，當(dāng)前序列需為 DNA 序列;默認(rèn)數(shù)據(jù)庫為蛋白質(zhì)序列時(shí)，當(dāng)前序列需為蛋白質(zhì)序列。DNAMAN 采用快速比對算法掃描序列相似性，結(jié)果輸出可選擇快速比對或最優(yōu)比對模式。

5、錯(cuò)配分析

該功能旨在查找引物與 DNA 序列所有潛在的退火位點(diǎn)，適用于 PCR 及 DNA 測序的引物篩選。通過權(quán)重矩陣區(qū)分引物各位置的重要性，3’末端對 PCR 擴(kuò)增的影響大于 5’末端，因此賦予 3’末端更高權(quán)重。為提升 PCR 引物特異性，需檢查引物與靶 DNA 是否存在非特異性退火位點(diǎn)。

dnaman軟件特色

1、DNA 與蛋白質(zhì)序列編纂

2、DNA 序列轉(zhuǎn)化

3、多序列比對、對齊修訂與解析

4、系統(tǒng)樹分析

5、DNA 或蛋白質(zhì)序列的點(diǎn)陣比對

6、DNA 序列組裝與修訂

7、通過內(nèi)網(wǎng) / 外網(wǎng)服務(wù)器的網(wǎng)絡(luò)界面進(jìn)行 BLAST 檢索

8、序列及數(shù)據(jù)庫中的強(qiáng)化型模式檢索

9、SiRNA 選擇器

10、酶切位點(diǎn)分析

11、繪制出版級序列圖譜

12、酶切模式預(yù)測

13、電子克隆

14、從酶切片段重建酶切圖譜

15、沉默突變分析(創(chuàng)建 / 破壞酶切位點(diǎn))

16、靶向錯(cuò)配構(gòu)建 / 消除酶切位點(diǎn)

17、翻譯及密碼子使用分析

18、蛋白質(zhì)疏水性 / 親水性分析

19、蛋白質(zhì)表征：序列組成與等電點(diǎn)預(yù)測

20、蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測

21、反向翻譯

22、PCR 及測序引物設(shè)計(jì)

23、DNA 或引物序列的熱力學(xué)性質(zhì)表征

24、差異演化分析

25、寡核苷酸、DNA 及蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫管理

26、隨機(jī)序列生成

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